В малых дозах препараты из корней щавеля конского оказывают вяжущее действие, а в больших – слабительное. Они также имеют кровоостанавливающий, гипотензивный, противоглистный эффект и стимулируют мускулатуру тонкого кишечника. Применяются внутрь как вяжущее и слабительное средство (в зависимости от дозы) при заболеваниях желудочно-кишечного тракта (энтеритах, колитах, атонических запорах), геморрое, трещинах заднего прохода; как кровоостанавливающее и противоглистное средство, а также для улучшения образования и выведения желчи и профилактики гипо- и авитаминоза.

Наружно настой и отвары конского щавеля используются для полосканий при воспалительных заболеваниях полости рта (ангина, язвенные стоматиты).

В народной медицине отваром конского щавеля лечат также кожные болезни.